Molte pubblicazioni scientifiche riguardano il possibile uso dei livelli di miRNA come strumenti diagnostici e prognostici per il cancro. Lo sviluppo di classificatori affidabili richiede di affrontare aspetti cruciali, alcuni dei quali sono stati ignorati in letteratura, qualis la distribuzione dei valori di miRNA misurati o l'incertezza statistica che affligge i parametri che caratterizzano il classificatore. A partire da un problema prototipo, i.e. la classificazione tra adenocarcinoma polmonare e carcinoma squamocellulare basata sull'espressione dei miRNA miR-205, miR-21 e snRNA U6, abbiamo sviluppato un nuovo classificatore Bayesiano e analizzato accuratamente le sue performance. Il metodo è stato pubblicato in:

L. Ricci, V. Del Vescovo, C. Cantaloni, M. Grasso, M. Barbareschi and M. A. Denti Statistical analysis of a Bayesian classifier based on the expression of miRNAs, BMC Bioinformatics 16 (2015), 287, doi:10.1186/s12859-015-0715-9

Il classificatore è stato quindi utilizzato in alcuni altri contesti, per esempio negli studi concernenti la demenzia fronto-temporale. Due pubblicazioni rappresentative in questo contesto sono:

  • M. Grasso, P. Piscopo, G. Talarico, L. Ricci, A. Crestini, G. Tosto, M. Gasparini, G. Bruno, M. A. Denti, and A. Confaloni, Plasma microRNAs profiling distinguishes patients with frontotemporal dementia from healthy subjects, Neurobiology of Aging 84 (2019, 240.e1-240.e12, doi:10.1016/j.neurobiolaging.2019.01.024.
  • S. Detassis, V. Del Vescovo, M. Grasso, S. Masella, C. Cantaloni, L. Cima, A. Cavazza, P. Graziano, G. Rossi, M. Barbareschi, L. Ricci, M. A. Denti, miR375-3p Distinguishes Low-Grade Neuroendocrine From Non-neuroendocrine Lung Tumors in FFPE Samples, Frontiers in Molecular Biosciences - Molecular Diagnostics and Therapeutics 7 (2020) 86, doi:10.3389/fmolb.2020.00086.

Il classificatore è stato inoltre implementato in un pacchetto software per l'ambiente R, MiRNAQCD (miRNA quality control and diagnosis), disponibile in questa repository GitHub, nonché nella nell'archivio CRAN. Il pacchetto è descritto nel dettaglio in:
M. Castelluzzo, A. Perinelli, S. Detassis, M. A. Denti and L. Ricci, MiRNA-QC-and-Diagnosis: An R package for diagnosis based on MiRNA expression, SoftwareX 12 (2020), 100569, doi:10.1016/j.softx.2020.100569